İki küçük çocuk İkinci Dünya Savaşı esnasında rahiplerin ilgilenmekte olduğu bir yatılı okulda arkadaş olurlar. Bu çocuklar Julien Quintin adındaki bir Fransız ve Jean Bonnet adındaki okul görevlilerinin saklamakta oldupu yahudi bir Almandır. Elveda Çocuklarda bu çocuklar başta birbirlerinden nefret ediyor olsalar da zaman geçtikçe aralarında özel bir bağ oluşur ve bir sırra ortak olurlar. Louis Malle bu filmde iki çocuğun ilişkisini gözler önüne sermiştir.